邳州市地方海事處現有干部職工104人，其中在職93人，退養2人，內退9人，黨員56名。機關內設科室7個，一線站點6個，其中2個海事所、4個巡航中隊、4個簽證點。其主要職能一是保，對轄區水域實施統一監管，保障轄區船舶航行。二是保暢通，維護好水上交通運輸秩序，保障航道暢通有序。三是防污染，對危險貨物裝卸、運輸進行監管，防止船舶污染。另外，還依法查處船舶違法行為，對轄區水上交通事故進行調查處理，對渡口渡船進行監管;依法對船舶進行檢查、簽證收費;協助上級船檢部門做好船舶建造檢驗和營運檢驗。
全市通航里程153KM，其中京杭運河干線航道42.8KM(二級航道)，中運河13.5KM(三級航道)，房亭河、西泇河、徐洪河等支線等級航道97.5KM;主要橋梁7座，船閘2道;境內鄉鎮渡口12道，其中京杭運河9道，沂河3道，每年渡運量在50萬余人;轄區擁有船舶萬余艘，年均新建船舶1余艘，航運企業30余家，運力約達60萬噸，隨著船舶日益大型化，運力還將逐步增加;沿線分布著包括邳州港、沂州港在內的港口碼頭36個，年吞吐量1千萬噸。
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